玻璃發酵罐常用于科研院所、大專院校以及企業的微生物實驗室，適用于微生物發酵培養基配方的篩選，發酵工藝參數的優化、生產工藝與菌種的驗證，是精密發酵理想的試驗設備。隨著發酵罐的應用范圍越來越廣

1.在食物工業上的使用：主要有三大類商品，一是出產傳統的發酵商品，如啤酒、果酒、食醋等；二是出產食物添加劑；三是協助解決糧食疑問。

2.在醫藥工業上的使用：根據發酵工程技能，開發了品種繁復的藥品，如人類生長激素、重組乙肝疫苗、某些品種的單克隆抗體、白細胞介素-2、抗血友病因子等。

3.在環境科學范疇的使用：污水處理中微生物的強化。